產(chǎn)品及特點(diǎn):
札幌病毒(也稱札如病毒)歸屬于嵌杯病毒科札幌樣病毒屬,最初于 1977年在日本札幌通過電鏡進(jìn)行檢測(cè)被發(fā)現(xiàn)。與諾沃客病毒類似,均屬于人類杯狀病毒,是非細(xì)菌性急性胃腸炎的主要病原體之一,可感染人和動(dòng)物引發(fā)腸胃炎。因此靈敏快捷的診斷產(chǎn)品具有重要的意義。本產(chǎn)品基于 PCR 原理開發(fā)。
1. 一站式,用于不需要單獨(dú)準(zhǔn)備每種成分,包括引物和對(duì)照。
2. 根據(jù)豬札如病毒(札幌病毒)的保守基因序列設(shè)計(jì)的引物,具有良好的特異性。
3. 基于染料法 qRT-PCR 檢測(cè),靈敏度比常規(guī) RT-PCR 高 10-100 倍,可以達(dá)到至少 1000 拷貝/反應(yīng)。
4. 使用一管式 qRT-PCR 技術(shù),RT 和 PCR 兩步在一個(gè)試管內(nèi)完成,不需要中間轉(zhuǎn)移樣品,降低了操作誤差和可能的污染。
5. 本產(chǎn)品足夠 50 次 30μL 體系的 RT-PCR。
規(guī)格及成分:
編號(hào)
|
成分
|
規(guī)格
|
試劑一
|
2×qRT-PCR 緩沖液
|
500 μL(棕色管)
|
試劑二
|
10×qRT-PCR 酶混合液
|
100 μL(紅蓋)
|
試劑三
|
ROX 染料 I,50×
|
20 μL(棕色管)
|
試劑四
|
ROX 染料 II,50×
|
20 μL(棕色管)
|
試劑五
|
熒光 PCR 專用模板稀釋液
|
1mL(黃蓋)
|
試劑六
|
豬札如病毒(札幌病毒)染料法 qRT-PCR 引物混合液
|
100 μL(白蓋)
|
試劑七
|
豬札如病毒(札幌病毒)染料法 qRT-PCR 陽(yáng)性對(duì)照 (1×10E8 /μL)
|
50 μL(黃蓋)
|
試劑八
|
沙核酸釋放劑(試用裝)
|
20 次(1mL,綠蓋)
|
試劑九
|
使用手冊(cè)
|
1 份
|
運(yùn)輸及保存:
低溫運(yùn)輸、-20℃保存,有效期一年。
陽(yáng)性對(duì)照需要因易污染其他成分需要單獨(dú)放置。本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽(yáng)性對(duì)照,只提供 DNA 片段作為陽(yáng)性對(duì)照。
自備試劑:
樣品 RNA。
使用方法:
一、稀釋陽(yáng)性對(duì)照:
以 10E2-10E7 這 6 個(gè) 10 倍稀釋度為例,由于標(biāo)準(zhǔn)品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨(dú)立的區(qū)域進(jìn)行。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴(kuò)散傳染性病原。
1. 標(biāo)記 6 個(gè)離心管,分別為 7,6,5,4,3,2。用帶芯槍頭分別加入 45 μL 熒光 PCR 專用模板稀釋液,最好用帶芯槍頭,下同)。
2. 在 7 號(hào)管中加入 5 μL 1×10E8 拷貝/μL 的陽(yáng)性對(duì)照(本試劑盒提供),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E7 拷貝/μL 的陽(yáng)性對(duì)照。放冰上待用。
3. 換槍頭,在 6 號(hào)管中加入 5 μL 1×10E7 拷貝/μL 的陽(yáng)性對(duì)照(上步稀釋所得),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E6 拷貝/μL 的陽(yáng)性對(duì)照。放冰上待用。
4. 換槍頭,在 5 號(hào)管中加入 5 μL 1×10E6 拷貝/μL 的陽(yáng)性對(duì)照(上步稀釋所得),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E5 拷貝/μL 的陽(yáng)性對(duì)照。放冰上待用。重復(fù)上面的操作直到得到 6 個(gè)稀釋度的陽(yáng)性對(duì)照。放冰上待用。
二、樣品 DNA 的制備:
5. 如果有 N 個(gè)樣品,必須設(shè)置 N+2 個(gè)提取,多出的一個(gè)是 PC(樣品制備陽(yáng)性對(duì)照),一個(gè)是 NC(樣品制備陰性對(duì)照)??梢杂?10μL 上步制備的陽(yáng)性對(duì)照梯度稀釋液中的第 4 號(hào)(濃度為 1×10E4 拷貝/μL,10μL 相當(dāng)于 1 萬(wàn)拷貝)再加上一定量的水作為制備的陽(yáng)性對(duì)照(加水后其總體積跟樣品一樣,樣品體積多少取決于所用試劑盒的要求)。可以用水作為制備的陰性對(duì)照。
6. 用自選方法純化 N+2 個(gè)樣品的 RNA,本試劑盒跟市場(chǎng)上大多數(shù)病毒 RNA 提取試劑盒兼容。
三、設(shè)置RT-PCR 反應(yīng)(20 μL 體系,在樣品制備室進(jìn)行):
7. 如果做定量分析并且只做 1 次重復(fù),則標(biāo)記 N+9 個(gè) PCR 管,其中 N+2 個(gè)用于上步得到的 N+2 個(gè)樣品,1 個(gè)用于 PCR 陰性對(duì)照,6 個(gè)用于標(biāo)準(zhǔn)曲線。如果做定性分析,并且只做 1 次重復(fù),則標(biāo)記 N+4 個(gè) PCR 管,其中 N+2 個(gè)用于上步得到的 N+2 個(gè)樣品,1 個(gè)用于 PCR 陰性對(duì)照(用水做模板),1 個(gè)用于 PCR 陽(yáng)性對(duì)照(用第 4 號(hào)陽(yáng)性對(duì)照稀釋液做模板)。下面只描述定量分析的步驟,定性分析只是把 6 個(gè)標(biāo)曲反應(yīng)縮減成 1 個(gè),其余不變。
8. 在標(biāo)記管中按下表加入各成分(本表只列出一次重復(fù)。樣品管和陰性對(duì)照設(shè)置完畢后才設(shè)置陽(yáng)性對(duì)照,陽(yáng)性對(duì)照樣品要等所有管子蓋上蓋子后最后加):
成分
|
N+2個(gè)制備
所得樣品
|
qRT-PCR
陰性對(duì)照
|
qRT-PCR陽(yáng)性對(duì)照(2-7管)
|
2×qRT-PCR緩沖液
|
10μL
|
10μL
|
各10μL
|
豬札如病毒(札幌病毒)染料法qRT-PCR引物混合物
|
2μL
|
2μL
|
各2μL
|
50×ROX (見注)
|
0.4μL
|
0.4μL
|
各0.4μL
|
樣品制備所得RNA
模板(來于第8步)
|
5.6μL
|
--
|
--
|
稀釋所得6個(gè)陽(yáng)性對(duì)照 (來于第6步)
|
--
|
--
|
各5.6μL2號(hào)樣到2號(hào) 管,3號(hào)樣到3號(hào)管
|
超純水
|
--
|
5.6μL
|
--
|
10×qRT-PCR酶混合液
|
2μL
|
2μL
|
2μL
|
注: 需使用 ROX 染料 I 的機(jī)型:ABI Prism7000、7300、7700、7900HT、Step-One、Step-One Plus。
需使用 ROX 染料 II 的機(jī)型:ABI Prism 7500、7500Fast、MJ Research的 Chromo4、Opticon(II)Corbett Rotor Gene 3000。
不需要使用ROX 的機(jī)型:Thermal Cycle Dice Real Time System,LightCycler、Smart Cycler System、Agilent Mx3000P、RotorGene3000、RotorGene 6000。
9. 上機(jī)后按下面參數(shù)進(jìn)行 RT-PCR(參數(shù)可能會(huì)因儀器不同而需優(yōu)化)。
過程
|
溫度
|
時(shí)間
|
RT(逆轉(zhuǎn)錄)
|
50℃
|
15-30 min
|
預(yù)變性
|
95℃
|
5 min
|
Qrt-PCR反應(yīng)40個(gè)循環(huán)
|
95℃
|
15 sec
|
58℃
|
1 min,(采集FAM通道的熒光信號(hào))
|
按儀器預(yù)設(shè)程序進(jìn)行溶解曲線分析
|
四、數(shù)據(jù)處理:
10. 如果把本試劑盒用于定量檢測(cè),則以陽(yáng)性對(duì)照濃度的 log 值為橫軸,以 Ct 值為縱軸,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。再以待測(cè)樣品的 Ct 值從標(biāo)準(zhǔn)曲線上推算出樣品 DNA濃度的 log 值,再推算出其濃度。
11. 如果把本試劑盒用于定性檢測(cè),只判斷陽(yáng)性或陰性,則陰性對(duì)照 Ct 必須大于或等于 40。陽(yáng)性對(duì)照必須有熒光對(duì)數(shù)增長(zhǎng),有典型擴(kuò)增曲線,Ct 值應(yīng)該小于或等于 30。對(duì)待測(cè)樣品,如果其 Ct 大于或等于 40 則為陰性,如果小于或等于 35 則為陽(yáng)性。如果在 35-40 之間,則重復(fù)一次。重復(fù)實(shí)驗(yàn)的 Ct 值如果大于或等于 40 則為陰性,如果小于 40,則為陽(yáng)性。
五、特別提示:
本公司的所有產(chǎn)品,僅可用于科研實(shí)驗(yàn),嚴(yán)禁用于臨床醫(yī)療及其他非科研用途!