產(chǎn)品及特點(diǎn):
人類(lèi)免疫缺陷病毒1型(HIV-1)患者血漿中病毒 RNA 水平一直以來(lái)是評(píng)判抗病毒治療效果或預(yù)測(cè)疾病進(jìn)展的重要指標(biāo)。但是,經(jīng)抗病毒治療后血漿 HIV-1RNA 已達(dá)到基線水平感染者的血液、精液或淋巴結(jié)中仍可以檢測(cè)到 HIV-1原病毒 DNA 的存在,構(gòu)成病毒儲(chǔ)藏庫(kù),對(duì)清除 HIV-1病毒構(gòu)成嚴(yán)重阻礙。所以在病毒載量已經(jīng)檢測(cè)不到的情況下,HIV-1原病毒 DNA 水平可以作為除 CD4+T細(xì)胞計(jì)數(shù)和病毒載量之外的另一標(biāo)志物。本公司開(kāi)發(fā) HIV-1 前病毒染料法熒光定量 PCR 試劑盒,
1. 即開(kāi)即用,用戶只需要提供病毒樣品。
2. 根據(jù)HIV-1前病毒保守序列設(shè)計(jì)的專(zhuān)一性引物,與相關(guān)病毒無(wú)交叉反應(yīng)。
3. 靈敏度可以達(dá)到幾百拷貝/反應(yīng)。
4. 一管式熒光定量 PCR 檢測(cè),避免后續(xù)污染。
5. 本試劑盒足夠 50 次 20μL 反應(yīng)體系的熒光定量 PCR。
規(guī)格及成分:
編號(hào)
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成分
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規(guī)格
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試劑一
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2×qPCR MagicMix
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500 μL(棕色管)
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試劑二
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熒光 PCR 專(zhuān)用模板稀釋液
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1 mL(黃蓋)
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試劑三
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HIV-1前病毒染料法PCR 引物混合液
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100 μL(白蓋)
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試劑四
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HIV-1前病毒染料法PCR陽(yáng)性對(duì)照(1×10E8)
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50 μL(紅蓋)
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試劑五
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DNA 病毒裂解液(試用裝)
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15 次(9 mL)
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使用手冊(cè)
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1 份
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運(yùn)輸及保存:
低溫運(yùn)輸、-20℃保存,有效期一年。
自備試劑:
DNA模板、10×ROX(根據(jù)機(jī)型決定,具體見(jiàn)使用方法)。
使用方法:
一、稀釋PCR陽(yáng)性對(duì)照(以10E2-10E7拷貝/μL這6個(gè)10倍稀釋度為例):
1.注意:由于標(biāo)準(zhǔn)品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨(dú)立的區(qū)域進(jìn)行,千萬(wàn)不能污染樣品或本試劑盒的其他成分)。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴(kuò)散傳染性病原,本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽(yáng)性對(duì)照,只提供可以直接使用的DNA片段作為陽(yáng)性對(duì)照。
2.標(biāo)記6個(gè)離心管,分別為7,6,5,4,3,2。
3.用帶芯槍頭分別加入45μL熒光PCR專(zhuān)用模板稀釋液(最好用帶芯槍頭,下同)。
4.在7號(hào)管中加入5μL1×10E8拷貝/μL的陽(yáng)性對(duì)照,充分震蕩1分鐘,得1×10E7拷貝/μL的陽(yáng)性對(duì)照。放冰上待用。
5.換槍頭,在6號(hào)管中加入5μL1×10E7拷貝/μL的陽(yáng)性對(duì)照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得1×10E6拷貝/μL的陽(yáng)性對(duì)照。放冰上待用。
6.換槍頭,在5號(hào)管中加入5μL1×10E6拷貝/μL的陽(yáng)性對(duì)照到5號(hào)管中,充分震蕩1分鐘,得1×10E5拷貝/μL的陽(yáng)性對(duì)照。放冰上待用。
7.重復(fù)上面的操作直到得到6個(gè)稀釋度的陽(yáng)性對(duì)照。放冰上待用。
二、樣品DNA的制備:
8.如果有N個(gè)樣品,必須設(shè)置N+2個(gè)提取,多出的一個(gè)是PC(樣品制備陽(yáng)性對(duì)照),一個(gè)是NC(樣品制備陰性對(duì)照)??梢杂?0μL上步制備的PCR陽(yáng)性對(duì)照的第4號(hào)(濃度為1×10E4拷貝/μL,10μL相當(dāng)于1萬(wàn)拷貝)或第5號(hào)(濃度為1×10E5拷貝/μL,10μL相當(dāng)于10萬(wàn)拷貝)再加上一定量的水使總體積跟每次制備要求的體積一樣,以此作為PC。另外用水作為NC。如果每次制備需要200μL樣品,則PC和NC的體積也必須是200μL。
9.用自選方法純化樣品的DNA,本試劑盒跟市場(chǎng)上大多數(shù)病毒DNA提取試劑盒兼容。也可以選購(gòu)本公司的一管式病毒DNAout或其升級(jí)版柱式病毒DNAout。本試劑盒免費(fèi)贈(zèng)送15次一管式病毒DNAout。
三、設(shè)置qPCR反應(yīng)(20μL體系,在樣品制備室進(jìn)行):
10. 如果只做 1 次重復(fù),則標(biāo)記 N+9 個(gè) PCR 管,其中 N+2 個(gè)用于上步得到的 N+2 個(gè)樣品,1 個(gè)用于 PCR 陰性對(duì)照,6 個(gè)用于 PCR 陽(yáng)性對(duì)照。如果做 2-3 次重復(fù),則反應(yīng)設(shè)置數(shù)量相應(yīng)增加 2 或 3 倍。
11. 在標(biāo)記管中按下表加入各成分(本表只列出一次重復(fù)。樣品管和陰性對(duì)照設(shè)置完畢后才設(shè)置陽(yáng)性對(duì)照,并且陽(yáng)性對(duì)照樣品要等所有管子蓋上蓋子儲(chǔ)存好后最后加):
成分
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樣品管 N+2個(gè)
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PCR陰性對(duì)照管
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PCR陽(yáng)性對(duì)照管(2-7管)
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2×qPCR MagicMix(棕色管)
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10μL
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10μL
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各10μL
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HIV-1前病毒PCR引物混合液(白蓋)
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2μL
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2μL
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各2μL
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自備10×ROX(見(jiàn)注)
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2μL
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2μL
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各2μL
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N+2待測(cè)樣品DNA模板
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6μL
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不加
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不加
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第7步所得PCR陽(yáng)性對(duì)照稀釋液(2-7號(hào))
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不加
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不加
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各6μL2號(hào)樣到2號(hào)管,3號(hào)樣到3號(hào)管
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注: 僅 ABI7500、7700 和 7900 儀器需要使用 ROX 作為對(duì)照,其他熒光 PCR 儀器(如 iCycler IQ、MJ Option、MJ Chromo4、MX3000、MX4000、RotorGene3000、RotorGene 6000 和 LightCycler480)不需要使用 ROX,則用水替代。
12.蓋上蓋子后上機(jī),按下面參數(shù)進(jìn)行PCR(具體PCR參數(shù)可以根據(jù)儀器不同而自行優(yōu)化)。
過(guò)程
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溫度
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時(shí)間
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預(yù)變性
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92℃
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5分鐘
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PCR反應(yīng)30個(gè)循環(huán)
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94℃
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60秒
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50℃
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60秒
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72℃
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60秒
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13.數(shù)據(jù)采集
具體操作按所用儀器推薦的流程進(jìn)行。本產(chǎn)品中所含的熒光染料在不結(jié)合DNA時(shí),最大吸收光譜在471nm,結(jié)合DNA時(shí)的最大吸收光譜在500nm,最大發(fā)射光譜在530nm。信號(hào)采集可以設(shè)置在復(fù)性或延伸步驟。
四、數(shù)據(jù)處理:
14.如果把本試劑盒用于定量檢測(cè),則以陽(yáng)性對(duì)照濃度的log值為橫軸,以Ct值為縱軸,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。再以待測(cè)樣品的Ct值從標(biāo)準(zhǔn)曲線上推算出樣品DNA濃度的log值,再推算出其濃度。
15. 如果把本試劑盒用于定性檢測(cè),只判斷陽(yáng)性或陰性,則陰性對(duì)照Ct必須大于或等于40。陽(yáng)性對(duì)照必須有熒光對(duì)數(shù)增長(zhǎng),有典型擴(kuò)增曲線,Ct值應(yīng)該小于或等于30。對(duì)待測(cè)樣品,如果其Ct大于或等于40則為陰性,如果小于或等于35則為陽(yáng)性。如果在35-40之間,則重復(fù)一次。重復(fù)實(shí)驗(yàn)的Ct值如果大于或等于40則為陰性,如果小于40,則為陽(yáng)性。
五、特別提示:
本公司的所有產(chǎn)品,僅可用于科研實(shí)驗(yàn),嚴(yán)禁用于臨床醫(yī)療及其他非科研用途!